B細胞抗體測序分析服務

B細胞,即B淋巴細胞,主要執行機體的體液免疫,在抗原刺激下分泌產生抗體并發揮作用。在適應性免疫應答期間,活化的B細胞擴增并經歷其B細胞受體(BCR)的體細胞超突變,形成多樣化的細胞克隆。此外,抗體作為復合物分子,其每個重鏈(VH)和輕鏈(VL)中存在三個互補決定區(CDR),并且重鏈的CDR3變化最為豐富,可在V,D和J基因區段之間的連接處形成并且傾向于高水平的超突變。因此,B細胞產生的天然VH / VL抗體對理解抗體生物學和設計至關重要。

服務優勢

  • 專有的抗體大數據平臺,可對抗體的重鏈和輕鏈配對進行打分,篩選最可能的完整抗體序列
  • 獨特的內部數據挖掘工具,對抗體測序結果進行預處理,降低假陽性等測序誤差
  • 完備的生物信息學分析,經驗豐富的抗體研究團隊,深度挖掘高價值信息
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          服務流程

          單細胞抗體測序分析服務1

          泓迅經典案例

          泓迅科技根據客戶所提供的抗體測序原始數據,通過生物信息學分析,對細胞VDJ重構、V/J基因頻率、V-J成對使用頻率、CDR3長度分析、B細胞克隆計數、受體多樣性分析、組間多樣性差異分析、組間V、J基因差異分析、組間克隆表達CDR3長度分布差異等詳細分析,并提供了專業的研究報告。

          結果展示:
          1) VDJ 基因使用頻率分析

          Table BCR樣本中 V 基因使用頻率統計


          Gene_name Reads Frequency
          4-39*01 27980 4.97
          4-34*01 12488 2.22
          1-2*02 5007 0.889
          3-74*01 4798 0.852
          1-18*01 3011 0.535
          3-7*01 2862 0.508
          2-70*13 2313 0.411
          3-74*03 2240 0.398
          1-69*01 1943 0.345
          4-31*03 1583 0.281

          單細胞抗體測序分析服務2

          2) CDR3 區域長度分析

          單細胞抗體測序分析服務3

          3) CDR3種類分析

          BCR測序統計CDR3氨基酸序列長度


          CDR3 Reads Frequency len
          DNNNDMR 3560 0.004869 7
          VISRTL 1688 0.002308 6
          AVDSNYQLI 899 0.001229 9
          AVNRDDKII 718 0.000982 9
          AATDSWGKLQ 696 0.000952 10
          AVTDSWGKLQ 627 0.000857 10
          AVNTGNQFY 595 0.000814 9
          AVTGGGNKLT 573 0.000784 10
          AVPTGTASKLT 562 0.000769 11
          LVGDTGRRALT 540 0.000738 11
          AEITLT 517 0.000707 6


          4) 序列總長排序

          BCR氨基酸序列總長reads數


          氨基酸基因序列長度 氨基酸數目 豐度
          1491 147 0.096324
          20 139 0.044324
          540 143 0.040395
          529 145 0.041238
          516 147 0.041955
          504 143 0.042773
          496 141 0.043976
          441 145 0.040898
          433 145 0.041868
          387 148 0.039055


          5) 不同樣本之間的VH基因的頻率差異分析

          單細胞抗體測序分析服務4

          6) 樣本測序飽和度分析

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          7) 克隆多樣性分析

          克隆多樣性分析

          上機類型 Shannon Entropy Inverse Simpson
          BCR 19.7458 340.758

          服務詳情

          服務名稱 主要內容 分析軟件 交付周期 交付項目
          B細胞抗體測序分析服務 測序數據挖掘;
          抗體信息分析等
          R, Python
          Software等
          7~10天 分析報告

          * 如需訂購抗體測序服務,請了解相關服務:雜交瘤細胞抗體基因測序、抗體組庫/免疫組庫測序,或詳詢support@synbio-tech.com。

          訂購與咨詢

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          2. 電話訂購:工作日您可以撥打免費熱線4000-973-630(按1);休息日您可直接撥打18262686586聯系我們
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