Syno?人類全基因組CRISPR文庫(Human Genome CRISPR Libraries)

CRISPR技術作為繼ZFN和TALEN之后第三代基因編輯技術,具有高效、快速、精準等特點,廣泛應用于基因功能研究、藥物開發、作物育種、分子診斷、精準醫療等領域。利用CRISPR 文庫進行基因組功能篩選一直是當下熱門的研究手段,被全球知名期刊爭相報道。

CRISPR文庫雖然是進行科學研究的強大工具,但是由于其后期篩選工作量大、成本消耗高,也成為了其普遍應用的阻礙。泓迅科技專注于CRISPR基因編輯技術的研究工作,不斷提升服務和產品的供應能力,在定制化CRISPR文庫構建的基礎上,推出Syno?人類全基因組CRISPR文庫,領先的設計和規范化的文庫構建實現高質量交付,降低客戶的研究成本,縮短產品交付周期。

文庫產品優勢

  1. 精準的sgRNA設計:利用有效的sgRNA設計模型結合深度學習算法,設計出具有高靶向活性和低脫靶率的sgRNA序列。
  2. 優化的載體:具備Puro藥篩功能,可進行慢病毒包裝,提高轉染效率。
  3. 節約成本:高編輯效率CRISPR文庫,減輕后期篩選工作的難度,降低研究成本。
  4. 一站式服務:提供NGS驗證、病毒包裝、生信分析等定制化的服務。
  5. 嚴格質控:構建的文庫覆蓋率>99.9%,均一性<10。
  6. 交付周期短:質粒文庫次日發貨。
    CRISPR-one-stop-service

文庫產品詳情

Syno?人類全基因組CRISPR敲除文庫

Syno?人類全基因組CRISPR敲除文庫根據Genome CRISPR數據庫中記錄的以前發表的CRISPR篩選中的表型以高靶向活性和低脫靶效率為準則,結合多種不同的設計原則,選擇評分較高的sgRNA序列。根據近期發表的評分規則,Syno?CRISPR文庫的評分要優于GeCKOv2文庫和隨機挑選的已發表sgRNA樣本。

Syno?人類全基因組CRISPR敲除文庫由三個獨立子庫A、B、C組成,A和B文庫分別針對18,913和18,334個蛋白質編碼基因。子庫A包含根據設計標準排名最好的sgRNA,在較低的文庫覆蓋率下實現高質量的篩選。子庫B包含第二層sgRNA,當需要更高的sgRNA覆蓋率時,可以用來補充子庫A。子庫C是通過整合大規模CRISPR篩選的標準化資源,以及多個效率指標,對廣泛采用的CRISPR文庫中的300,000多個特有的sgRNA進行評估和排序,設計出了一個優化的人類最小全基因組敲除文庫,針對18,761個基因,每個基因設計2個優化的sgRNA,合計有37,522個基因靶向和200個非靶向sgRNA。子庫C的大小比目前公開的人類全基因組CRISPR文庫均小。雖然子庫C較小但是并不影響對必須基因的識別,多用于復雜條件下癌癥細胞模型的CRISPR篩選。

產品編號 產品名稱 序列信息 載體信息 價格(元) 規格
STCRI211101 Syno?人類全基因組
CRISPR敲除文庫
(Human Genome CRISPR Knockout Libraries)
子庫A:
靶向18,913個基因,設計74,552個sgRNA序列和435個對照(非靶向)sgRNA序列,合計74,987個sgRNA序列。
pLentiCRISPR v2-Puro
(單質粒系統)pLentiGuide-Puro
(雙質粒系統)pLentiGuide-Puro-GFP
(雙質粒系統)
咨詢 200μg
STCRI211102 子庫B:
靶向18,334個基因,設計71,048個sgRNA序列和435個對照(非靶向)sgRNA序列,合計71,483個sgRNA序列。
pLentiCRISPR v2-Puro
(單質粒系統)pLentiGuide-Puro
(雙質粒系統)pLentiGuide-Puro-GFP
(雙質粒系統)
咨詢 200μg
STCRI211103 子庫C:
靶向18,761個基因,設計37,522個sgRNA序列和200個對照(非靶向)sgRNA序列,合計37,722個sgRNA序列。
pLentiCRISPR v2-Puro
(單質粒系統)pLentiGuide-Puro
(雙質粒系統)pLentiGuide-Puro-GFP
(雙質粒系統)
咨詢 200μg

*更多服務信息,請咨詢support@synbio-tech.com。

Syno?人類全基因組CRISPR激活文庫

產品編號 產品名稱 序列信息 載體信息 價格(元) 規格
STCRI233301 Syno?人類全基因組
CRISPR激活文庫
(Human Genome CRISPR Activation Library)
子庫A:
靶向18,885個基因,設計56,266個sgRNA序列和496個對照(非靶向)sgRNA序列,sgRNA大小20 bp。
Syn-pXPR_502
(雙質粒系統)
咨詢 200μg
STCRI233302 子庫B:
靶向18,843個基因,設計55,980個sgRNA序列和496個對照(非靶向)sgRNA序列,sgRNA大小20 bp。
Syn-pXPR_502
(雙質粒系統)
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Syno?人類膜蛋白CRISPR激活文庫

產品編號 產品名稱 序列信息 載體信息 價格(元) 規格
STCRI113345 Syno?人類膜蛋白
CRISPR激活文庫
(Human Membrane Protein CRISPR Activation Library)
靶向6,213個基因的啟動子,設計58,071個sgRNA序列和500個對照(非靶向)sgRNA序列,合計58,571個sgRNA序列。 pKVL2-U6gRNA_
SAM(BbsI)-PGKpuroBFP-W
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Human Pathway sgRNA文庫

CRISPR文庫是基于CRISPR/Cas9技術建立的高通量基因篩選方案,研究基因在代謝通路或某些特定疾病發生過程中的功能,確認與表型相關的基因或篩選藥物新靶點。

泓迅科技專注于CRISPR基因編輯技術的研究與開發,在CRISPR定制化文庫構建服務的基礎上,為持續提升產品和服務供應能力,從基因、細胞、免疫系統等不同研究層面推出100多種Human pathway sgRNA文庫,為特定通路的靶向篩選等相關研究提供高效工具。

產品優勢

  1. 100+ Human pathway sgRNA文庫供客戶選擇
  2. 文庫的靶點基因是通過KEGG與較新的NCBI RefSeq人基因組數據交叉、并與科學研究前沿相結合下的選擇
  3. 泓迅科技SynoGPS平臺下的獨家算法設計,每個靶點包含4條低脫靶效率的sgRNA序列
  4. 200+定制化文庫交付經驗,保證產品質量
  5. 相關客戶陸續發表文獻26篇,最高影響因子達36.558

人源Pathway sgRNA文庫信息表如下:

代謝過程 文庫編號 通路名稱 載體 基因數目
常見通路(現貨) SHPF231311 ABC transporter pathway Lentisyn001 100
SHPF231312 Acute myeloid leukemia pathway 45
SHPF231313 Adipogenesis pathway 126
SHPF231314 Adult stem cell pathway 58
SHPF231315 Angiogenesis pathway 92
SHPF231316 Apoptosis pathway 68
SHPF231317 cAMP&Ca pathway 91
SHPF231318 Cell cycle pathway 84
SHPF231319 Chemokine pathway 134
SHPF231320 Drug Resistance pathway 348
SHPF231321 ES differentiation pathway 334
SHPF231322 GPCR pathway 280
SHPF231323 Hormone activity pathway 108
SHPF231324 Ion channel pathway 67
SHPF231325 P450 pathway 57
SHPF231326 Tumor metastasis pathway 60
SHPF231327 Tumor suppressor pathway 720
SHPF231328 Neelamegham human glycogene pathway 347
SHPF231329 Human mTORC1 pathway 713
SHPF231330 Pan druggable library 75
DNA復制與修復 SHPF231001 Base excision repair 33
SHPF231002 DNA replication 36
SHPF231003 Fanconi anemia pathway 54
SHPF231004 Homologous recombination 41
SHPF231005 Mismatch repair 23
SHPF231006 Non-homologous end-joining 13
SHPF231007 Nucleotide excision repair 47
轉錄 SHPF232001 Basal transcription factors 45
SHPF232002 RNA polymerase 34
SHPF232003 Spliceosome 154
翻譯 SHPF233001 Aminoacyl-tRNA biosynthesis 66
SHPF233002 mRNA surveillance pathway 97
SHPF233003 Nucleocytoplasmic pathway 108
SHPF233004 Ribosome biogenesis in eukaryotes 118
SHPF233005 Ribosome 167
運輸與分解代謝 SHPF234001 Autophagy 141
SHPF234002 Endocytosis 251
SHPF234003 Lysosome 132
SHPF234004 Mitophagy 72
SHPF234005 Peroxisome 82
SHPF234006 Phagosome 152
細胞群落 SHPF235001 Adherens junction 71
SHPF235002 Focal adhesion 201
SHPF235003 Gap junction 88
SHPF235004 Signaling pathways regulating pluripotency of stem cells 143
SHPF235005 Tight junction 169
細胞死亡 SHPF236001 Apoptosis 136
SHPF236002 Cell cycle 127
SHPF236003 Cellular senescence 156
SHPF236004 Ferroptosis 41
SHPF236005 Necroptosis 159
SHPF236006 Oocyte meiosis 131
SHPF236007 p53 signaling pathway 73
細胞運動 SHPF236101 Regulation of actin cytoskeleton 229
折疊,分選及降解 SHPF237001 Proteasome 46
SHPF237002 Protein export 23
SHPF237003 Protein processing in endoplasmic reticulum 171
SHPF237004 RNA degradation 79
SHPF237005 SNARE interactions in vesicular transport 33
SHPF237006 Sulfur relay system 8
SHPF237007 Ubiquitin mediated proteolysis 142
生長與再生 SHPF238001 Axon guidance 182
SHPF238002 Osteoclast differentiation 128
信號轉導 SHPF239001 AMPK signaling pathway 121
SHPF239002 Apelin signaling pathway 139
SHPF239003 Calcium signaling pathway 240
SHPF239004 cAMP signaling pathway 225
SHPF239005 cGMP-PKG signaling pathway 167
SHPF239006 ErbB signaling pathway 85
SHPF239007 FoxO signaling pathway 131
SHPF239008 Hedgehog signaling pathway 56
SHPF239009 HIF-1 signaling pathway 109
SHPF239010 Hippo signaling pathway 157
SHPF239011 JAK-STAT signaling pathway 166
SHPF239012 MAPK signaling pathway 294
SHPF239013 mTOR signaling pathway 156
SHPF239014 NF-kappa B signaling pathway 104
SHPF239015 Notch signaling pathway 59
SHPF239016 Phosphatidylinositol signaling system 97
SHPF239017 Phospholipase D signaling pathway 148
SHPF239018 PI3K-Akt signaling pathway 354
SHPF239019 Rap1 signaling pathway 210
SHPF239020 Ras signaling pathway 236
SHPF239021 Sphingolipid signaling pathway 119
SHPF239022 TGF-beta signaling pathway 95
SHPF239023 TNF signaling pathway 114
SHPF239024 VEGF signaling pathway 59
SHPF239025 Wnt signaling pathway 170
信號分子與互作 SHPF231011 Cell adhesion molecules 157
SHPF231012 Cytokine-cytokine receptor interaction 295
SHPF231013 ECM-receptor interaction 88
SHPF231014 Neuroactive ligand-receptor interaction 367
SHPF231015 Viral protein interaction with cytokine and cytokine receptor 100
循環系統 SHPF231111 Adrenergic signaling in cardiomyocytes 154
SHPF231112 Cardiac muscle contraction 87
SHPF231113 Vascular smooth muscle contraction 134
免疫系統 SHPF231211 Antigen processing and presentation 78
SHPF231212 B cell receptor signaling pathway 82
SHPF231213 Chenokine signaling pathway 192
SHPF231214 Complement and coagulation cascades 86
SHPF231215 C-type lectin receptor signaling pathway 104
SHPF231216 Cytosolic DNA-sensing pathway 66
SHPF231217 Fc epsilon RI signaling pathway 68
SHPF231218 Fc ganna R-mediated phagocytosis 97
SHPF231219 Hematopoietic cell lineage 99
SHPF231220 IL-17 signaling pathway 94
SHPF231221 Intestinal immune network for IgA production 49
SHPF231222 Leukocyte transendothelial migration 114
SHPF231223 Natural killer cell mediated cytotoxicity 132
SHPF231224 Neutrophil extracellular trap formation 190
SHPF231225 NOD-like receptor signaling pathway 186
SHPF231226 Platelet activation 124
SHPF231227 RIG-I-like receptor signaling pathway 71
SHPF231228 T cell receptor signaling pathway 104
SHPF231229 Th1 and Th2 cell differntiation 92
SHPF231230 Th17 cell differentiation 108
SHPF231231 Toll-like receptor signaling pathway 104

Pathway sgRNA質粒文庫交付內容

1、混合池(成品,也可定制化)

文庫所有基因的sgRNA于1管中混合,可直接用于轉染或慢病毒包裝(圖1)。

圖1

交付內容:

  • ? 200μg液態質粒
  • ? CoA文件

2、陣列形式(定制化)

以一孔對應一靶標基因的陣列板形式提供,實現對靶標基因的靈活運用(圖2)。

圖2

交付內容:

  • ? 陣列板式液態質粒
  • ? 基因陣列排布信息
  • ? CoA文件

參考資料
[1] Luisa Henkel, Benedikt Rauscher, Barbara Schmitt, et al. Genome-scale CRISPR screening at high sensitivity with an empirically designed sgRNA library. BMC Biol. 2020; 18: 174.
[2]Emanuel Gon?alves, Mark Thomas, Fiona M. Behan, et al. Minimal genome-wide human CRISPR-Cas9 library. Genome Biol. 2021; 22: 40.

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